RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548847.1

SLC25A3-211, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-211ENST00000548847 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.95■■■■■ 5.11
SLC25A3-211ENST00000548847 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.77■■■■■ 4.28
SLC25A3-211ENST00000548847 ABCC9O60706 1549 aa40.99■■■■■ 4.15
SLC25A3-211ENST00000548847 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.34■■■■□ 3.89
SLC25A3-211ENST00000548847 NACADO15069 1562 aa39.28■■■■□ 3.88
SLC25A3-211ENST00000548847 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.17■■■■□ 3.86
SLC25A3-211ENST00000548847 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
SLC25A3-211ENST00000548847 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.03■■■■□ 3.84
SLC25A3-211ENST00000548847 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.83■■■■□ 3.81
SLC25A3-211ENST00000548847 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.52■■■■□ 3.76
SLC25A3-211ENST00000548847 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.27■■■■□ 3.72
SLC25A3-211ENST00000548847 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.25■■■■□ 3.71
SLC25A3-211ENST00000548847 SCRIBQ14160 1630 aa38.11■■■■□ 3.69
SLC25A3-211ENST00000548847 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.78■■■■□ 3.64
SLC25A3-211ENST00000548847 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.76■■■■□ 3.64
SLC25A3-211ENST00000548847 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
SLC25A3-211ENST00000548847 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.08■■■■□ 3.53
SLC25A3-211ENST00000548847 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.83■■■■□ 3.49
SLC25A3-211ENST00000548847 SMARCA4P51532 1647 aa36.45■■■■□ 3.43
SLC25A3-211ENST00000548847 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
SLC25A3-211ENST00000548847 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.29■■■■□ 3.4
SLC25A3-211ENST00000548847 NCAPD3P42695 1498 aa36.28■■■■□ 3.4
SLC25A3-211ENST00000548847 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.2■■■■□ 3.39
SLC25A3-211ENST00000548847 SMARCA2P51531 1590 aa36.2■■■■□ 3.38
SLC25A3-211ENST00000548847 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.11■■■■□ 3.37
SLC25A3-211ENST00000548847 HMGXB3Q12766 1538 aa36.08■■■■□ 3.37
SLC25A3-211ENST00000548847 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
SLC25A3-211ENST00000548847 WIZO95785 1651 aa35.79■■■■□ 3.32
SLC25A3-211ENST00000548847 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
SLC25A3-211ENST00000548847 NESP48681 1621 aa35.46■■■■□ 3.27
SLC25A3-211ENST00000548847 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
SLC25A3-211ENST00000548847 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.31■■■■□ 3.24
SLC25A3-211ENST00000548847 ERCC6Q03468 1493 aa35.28■■■■□ 3.24
SLC25A3-211ENST00000548847 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.19■■■■□ 3.22
SLC25A3-211ENST00000548847 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.05■■■■□ 3.2
SLC25A3-211ENST00000548847 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.02■■■■□ 3.2
SLC25A3-211ENST00000548847 CFTRP13569 1480 aa34.99■■■■□ 3.19
SLC25A3-211ENST00000548847 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.98■■■■□ 3.19
SLC25A3-211ENST00000548847 CUX2O14529 1486 aa34.98■■■■□ 3.19
SLC25A3-211ENST00000548847 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
SLC25A3-211ENST00000548847 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.79■■■■□ 3.16
SLC25A3-211ENST00000548847 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.75■■■■□ 3.15
SLC25A3-211ENST00000548847 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.73■■■■□ 3.15
SLC25A3-211ENST00000548847 PRDM2Q13029 1718 aa34.69■■■■□ 3.14
SLC25A3-211ENST00000548847 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
SLC25A3-211ENST00000548847 WDR62O43379 1518 aa34.65■■■■□ 3.14
SLC25A3-211ENST00000548847 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
SLC25A3-211ENST00000548847 TOPBP1Q92547 1522 aa34.24■■■■□ 3.07
SLC25A3-211ENST00000548847 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.18■■■■□ 3.06
SLC25A3-211ENST00000548847 ABCC8Q09428 1581 aa34.17■■■■□ 3.06
SLC25A3-211ENST00000548847 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.05■■■■□ 3.04
SLC25A3-211ENST00000548847 IFT140Q96RY7 1462 aa34.03■■■■□ 3.04
SLC25A3-211ENST00000548847 CUX1P39880 1505 aa33.96■■■■□ 3.03
SLC25A3-211ENST00000548847 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
SLC25A3-211ENST00000548847 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
SLC25A3-211ENST00000548847 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
SLC25A3-211ENST00000548847 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.84■■■■□ 3.01
SLC25A3-211ENST00000548847 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.81■■■■□ 3
SLC25A3-211ENST00000548847 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
SLC25A3-211ENST00000548847 SOGA1O94964 1423 aa33.77■■■■□ 3
SLC25A3-211ENST00000548847 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.7■■■□□ 2.999e-10■■■■■ 45.4
SLC25A3-211ENST00000548847 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.66■■■□□ 2.98
SLC25A3-211ENST00000548847 SYNJ1O43426 1573 aa33.63■■■□□ 2.97
SLC25A3-211ENST00000548847 TOP2BQ02880 1626 aa33.62■■■□□ 2.97
SLC25A3-211ENST00000548847 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.62■■■□□ 2.97
SLC25A3-211ENST00000548847 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
SLC25A3-211ENST00000548847 WDR97A6NE52 1622 aa33.6■■■□□ 2.97
SLC25A3-211ENST00000548847 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.51■■■□□ 2.95
SLC25A3-211ENST00000548847 OSCARQ8IYS5 282 aa33.47■■■□□ 2.95
SLC25A3-211ENST00000548847 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.4■■■□□ 2.94
SLC25A3-211ENST00000548847 GRIN2BQ13224 1484 aa33.39■■■□□ 2.94
SLC25A3-211ENST00000548847 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.38■■■□□ 2.93
SLC25A3-211ENST00000548847 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.38■■■□□ 2.93
SLC25A3-211ENST00000548847 CHD1O14646 1710 aa33.36■■■□□ 2.93
SLC25A3-211ENST00000548847 PBRM1Q86U86 1689 aa33.33■■■□□ 2.93
SLC25A3-211ENST00000548847 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
SLC25A3-211ENST00000548847 FBLN2P98095 1184 aa33.24■■■□□ 2.91
SLC25A3-211ENST00000548847 SYNJ2O15056 1496 aa33.2■■■□□ 2.91
SLC25A3-211ENST00000548847 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.14■■■□□ 2.9
SLC25A3-211ENST00000548847 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.09■■■□□ 2.89
SLC25A3-211ENST00000548847 ADAMTS12P58397 1594 aa33.08■■■□□ 2.89
SLC25A3-211ENST00000548847 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.03■■■□□ 2.88
SLC25A3-211ENST00000548847 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.02■■■□□ 2.88
SLC25A3-211ENST00000548847 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.02■■■□□ 2.88
SLC25A3-211ENST00000548847 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.02■■■□□ 2.88
SLC25A3-211ENST00000548847 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33■■■□□ 2.87
SLC25A3-211ENST00000548847 ARHGEF11O15085 1522 aa33■■■□□ 2.87
SLC25A3-211ENST00000548847 GRIN2AQ12879 1464 aa32.98■■■□□ 2.87
SLC25A3-211ENST00000548847 KIF27Q86VH2 1401 aa32.95■■■□□ 2.86
SLC25A3-211ENST00000548847 IGF1RP08069 1367 aa32.87■■■□□ 2.85
SLC25A3-211ENST00000548847 NUP160Q12769 1436 aa32.86■■■□□ 2.85
SLC25A3-211ENST00000548847 CEP170Q5SW79 1584 aa32.85■■■□□ 2.85
SLC25A3-211ENST00000548847 TRIM41Q8WV44 630 aa32.84■■■□□ 2.85
SLC25A3-211ENST00000548847 CUL7Q14999 1698 aa32.75■■■□□ 2.83
SLC25A3-211ENST00000548847 ARAP1Q96P48 1450 aa32.74■■■□□ 2.83
SLC25A3-211ENST00000548847 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.69■■■□□ 2.82
SLC25A3-211ENST00000548847 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.65■■■□□ 2.82
SLC25A3-211ENST00000548847 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.64■■■□□ 2.82
SLC25A3-211ENST00000548847 SHROOM2Q13796 1616 aa32.63■■■□□ 2.81
SLC25A3-211ENST00000548847 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms