Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms