Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4B1Q9Y6B7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms