Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB6Q9Y5E3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PCDHB6Q9Y5E3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB6Q9Y5E3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB6Q9Y5E3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms