Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAN1Q9Y2M0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAN1Q9Y2M0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms