Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP20Q9Y2K6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP20Q9Y2K6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms