Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNB3Q9ULL4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXNB3Q9ULL4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms