Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB23Q9ULC3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms