Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXL3Q9UKT7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXL3Q9UKT7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms