Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCOR1Q9UKL0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RCOR1Q9UKL0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RCOR1Q9UKL0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms