Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM7Q9UK45 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LSM7Q9UK45 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM7Q9UK45 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms