Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK3Q9UBP4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK3Q9UBP4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms