Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB6

NCDN, Neurochondrin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCDNQ9UBB6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCDNQ9UBB6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCDNQ9UBB6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCDNQ9UBB6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms