Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN3Q9P232 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTN3Q9P232 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms