Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKIRAS2Q9NYR9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NKIRAS2Q9NYR9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms