Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNK4Q9NYG8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK4Q9NYG8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNK4Q9NYG8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms