Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTPS2Q9NRF8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTPS2Q9NRF8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS2Q9NRF8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms