Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASS4Q9NQ75 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASS4Q9NQ75 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASS4Q9NQ75 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1110.7 ms