Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IL1RAPQ9NPH3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IL1RAPQ9NPH3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL1RAPQ9NPH3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms