Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XAB2Q9HCS7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XAB2Q9HCS7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XAB2Q9HCS7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms