Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPB41L4AQ9HCS5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EPB41L4AQ9HCS5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EPB41L4AQ9HCS5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EPB41L4AQ9HCS5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EPB41L4AQ9HCS5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
EPB41L4AQ9HCS5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPB41L4AQ9HCS5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPB41L4AQ9HCS5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms