Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLSTN2Q9H4D0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSTN2Q9H4D0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms