Protein–RNA interactions for Protein: Q9H426

RIMS4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS4Q9H426 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS4Q9H426 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RIMS4Q9H426 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIMS4Q9H426 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms