Protein–RNA interactions for Protein: Q9H175

CSRNP2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2Q9H175 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP2Q9H175 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP2Q9H175 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP2Q9H175 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP2Q9H175 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP2Q9H175 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CSRNP2Q9H175 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CSRNP2Q9H175 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP2Q9H175 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP2Q9H175 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms