Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARD11Q9BXL7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARD11Q9BXL7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARD11Q9BXL7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARD11Q9BXL7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARD11Q9BXL7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARD11Q9BXL7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARD11Q9BXL7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARD11Q9BXL7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARD11Q9BXL7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARD11Q9BXL7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARD11Q9BXL7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CARD11Q9BXL7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARD11Q9BXL7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARD11Q9BXL7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARD11Q9BXL7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARD11Q9BXL7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARD11Q9BXL7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARD11Q9BXL7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARD11Q9BXL7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARD11Q9BXL7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARD11Q9BXL7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARD11Q9BXL7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CARD11Q9BXL7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CARD11Q9BXL7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARD11Q9BXL7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms