Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWM7

SFXN3, Sideroflexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN3Q9BWM7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SFXN3Q9BWM7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms