Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC94Q9BW85 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC94Q9BW85 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms