Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00467Q9BRT7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms