Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LARP6Q9BRS8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP6Q9BRS8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LARP6Q9BRS8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms