Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MXRA8Q9BRK3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MXRA8Q9BRK3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MXRA8Q9BRK3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MXRA8Q9BRK3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MXRA8Q9BRK3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MXRA8Q9BRK3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MXRA8Q9BRK3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MXRA8Q9BRK3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms