Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
FYCO1Q9BQS8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
FYCO1Q9BQS8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
FYCO1Q9BQS8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FYCO1Q9BQS8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
FYCO1Q9BQS8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC38■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms