Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALS2CR12Q96Q35 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2CR12Q96Q35 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALS2CR12Q96Q35 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms