Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD27Q96NW4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD27Q96NW4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms