Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPOR3Q96MK2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPOR3Q96MK2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RIPOR3Q96MK2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms