Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD8Q96LT4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD8Q96LT4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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