Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG1Q96JA1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms