Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VSIG2Q96IQ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VSIG2Q96IQ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VSIG2Q96IQ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VSIG2Q96IQ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VSIG2Q96IQ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VSIG2Q96IQ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VSIG2Q96IQ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VSIG2Q96IQ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VSIG2Q96IQ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VSIG2Q96IQ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VSIG2Q96IQ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VSIG2Q96IQ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSIG2Q96IQ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VSIG2Q96IQ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms