Protein–RNA interactions for Protein: Q96HV5

TMEM41A, Transmembrane protein 41A, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41AQ96HV5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM41AQ96HV5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM41AQ96HV5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM41AQ96HV5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM41AQ96HV5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM41AQ96HV5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM41AQ96HV5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM41AQ96HV5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM41AQ96HV5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM41AQ96HV5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM41AQ96HV5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM41AQ96HV5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM41AQ96HV5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM41AQ96HV5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM41AQ96HV5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms