Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP6Q96FZ7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP6Q96FZ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP6Q96FZ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms