Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGF29Q96ES7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGF29Q96ES7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms