Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP3Q96DZ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP3Q96DZ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP3Q96DZ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP3Q96DZ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP3Q96DZ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLIP3Q96DZ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP3Q96DZ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP3Q96DZ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms