Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC45Q96CN5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC45Q96CN5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC45Q96CN5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC45Q96CN5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC45Q96CN5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC45Q96CN5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC45Q96CN5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC45Q96CN5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC45Q96CN5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC45Q96CN5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC45Q96CN5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC45Q96CN5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC45Q96CN5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC45Q96CN5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC45Q96CN5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms