Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC47Q96A33 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC47Q96A33 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
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