Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PRG4Q92954 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
PRG4Q92954 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PRG4Q92954 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRG4Q92954 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms