Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUBCNQ92622 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUBCNQ92622 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUBCNQ92622 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUBCNQ92622 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUBCNQ92622 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUBCNQ92622 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms