Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEDD1Q8NHV4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NEDD1Q8NHV4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEDD1Q8NHV4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NEDD1Q8NHV4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NEDD1Q8NHV4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEDD1Q8NHV4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEDD1Q8NHV4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEDD1Q8NHV4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD1Q8NHV4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD1Q8NHV4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD1Q8NHV4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD1Q8NHV4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms