Protein–RNA interactions for Protein: Q8NGF0

OR52B6, Olfactory receptor 52B6, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR52B6Q8NGF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OR52B6Q8NGF0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OR52B6Q8NGF0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OR52B6Q8NGF0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms