Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNERQ8NFT8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNERQ8NFT8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DNERQ8NFT8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNERQ8NFT8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms