Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF38AQ8NAV1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38AQ8NAV1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF38AQ8NAV1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms