Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSTM4Q8IW00 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSTM4Q8IW00 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VSTM4Q8IW00 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms